Il Comando Operativo (OPCOM - Operational Command) delle forze nazionali impegnate nell'operazione è esercitato dal Capo di Stato Maggiore della Difesa Comandante in Capo delle forze della Difesa (CINC DIFESA - Commander in Chief Difesa).
Il Controllo Operativo (OPCON- Operational Control) degli assetti nazionali schierati in area di operazione è delegato al COM ISAF (Comandante ISAF).
Per quanto riguarda il personale militare e gli assetti nazionali impiegati nell'operazione che non transitano sotto l'Autorità multinazionale, l'OPCON è delegato al Comandante del Comando Operativo di vertice Interforze (COM COI) che, a sua volta, lo delega all'NCC competente per funzione.

Il personale è soggetto al Codice Penale Militare di Pace.
Il Comandante del Contingente Nazionale (NCC) assicura l'unitarietà di Comando per quanto attiene gli aspetti nazionali, su tutte le forze italiane. Ha, quale specifico compito, quello di verificare che le forze nazionali siano impiegate nel rispetto del regime di deleghe in atto.